মি. হরগোবিন্দ সেন বা বাবু হরগোবিন্দ সেন রাজশাহী কলেজের প্রথম অধ্যক্ষ ছিলেন। সে সময়ে তিনি রাজশাহী জিলা স্কুলের (বর্তমানে রাজশাহী কলেজিয়েট স্কুল) প্রধান শিক্ষক ছিলেন। তিনি পাঁচ বছর (১৮৭৩-১৮৭৮) এই কলেজের অধ্যক্ষ্যের দায়িত্বে ছিলেন।
ঐতিহ্যবাহী রাজশাহী কলেজের প্রথম অধ্যক্ষ হিসেবে ইতিহাসে স্থান করে নেন তৎকালীন রাজশাহী জিলা স্কুল (পূর্বের বাউলিয়া ইংলিশ স্কুল) এর প্রধান শিক্ষক বাবু হরগোবিন্দ সেন। ছয়জন শিক্ষার্থী নিয়ে ফার্স্ট আটর্স ক্লাসের মাধ্যমে ১৮৭৩ সালে যাত্রা শুরু হয় হয় রাজশাহী কলেজের। রাজশাহী এসোসিয়েশনের অবিস্মরণীয় উদ্যোগে ১৮৭৫ সালেই বি.এ ক্লাস খোলার প্রস্তাব প্রেরিত হয় হয় কর্তৃপক্ষের সমীপে। সরকারের অনুমতি পেয়ে ১৮৭৮ সালে বি.এ ক্লাস খোলা হয় এবং কলেজটি প্রথম শ্রেণির কলেজের মর্যাদা লাভ করে। অধ্যক্ষ হিসেবে বাবু হরগোবিন্দ সেন কর্তৃপক্ষের সঙ্গে যোগাযোগ রক্ষায় অবশ্যই গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখেন।